1916 年 10 月 31 日，卫理公会建筑与选址委员会秘书在 Amokiah 区购买了一块面积为 93 000 平方英尺的土地，用于建造一所学校。它是巴耶利峇 MGS 的开始。
这所学校最初是英华学校的一个分支，当时被称为巴耶利峇英语学校。第一任校长是罗伯特·哈南先生。当它于 1917 年开始运作时，它有 3 名教职员工和 24 名男生。 1918 年，它开始招收女孩。这是一所提供小学四年级教育的小学。
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1935年，周福轩夫人(周福轩牧师的妻子，坐在全家福的女士)成为学校的校长。她一直担任这一职务，直到 1957 年退休。她被视为巴耶利峇 MGS 的创始人，因为她在二战期间校舍被夷为平地后，在美国十字军基金的帮助下重组了学校二、她创办了女子学校。学校在上午的课程中与女孩们混在一起，在下午的课程中与男孩们混在一起。
1949年，学校成为政府资助学校。那还是一所小学。渐渐地，一个又一个的中学增加了，1954年，学校颁发了第一批中学毕业证书的女孩，结果是100%通过。
1986 年，巴耶利峇从边界路迁往位于罗弄亚洙的应许之地。这导致创建了两所学校 – 巴耶利峇卫理公会女子学校(小学)和巴耶利峇卫理公会女子学校(中学)。
1987 年 8 月 22 日，时任教育国务部长郑永顺博士正式宣布 PLMGS(P)和 PLMGS(S)开放，并由何志信主教献给上帝的荣耀。